Eso mismo que vas aprendiendo lo vas a tener que aplicar sobre una imagen del juego que este limpia, es decir:
Todos los archivos que tenga dentro el DVD del juego de PS2 lo guardas en una carpeta en tu PC, y esos archivos bajados los vas editando segun corresponda utilizando los programas correspondientes, y una vez que creas que ya esta listo el juego parcheado, lo grabas a 2x o 4x como mucho, y seguro tiene que funcionar.
Mucha suerte y como recomendación te digo que es bueno que imprimas los tutoriales y vayas tomandolos como referencia para todos los programas.
Saludos,