Básicamente se trata de abrir el juego, ver la bandera a reemplazar, buscarla en el 0_text con el GGS y reemplazarla por la que queremos.
http://rapidshare.com/files/17989048/Tutorial_Insertar_Banderas.rar.html
Espero que les resulte útil.
Tengan piedad q es el primer video tutorial que hago

Requisitos:
+ Game Graphic Studio 6.11
http://www.dekazeta.net/index.php?automodule=downloads&req=idx&cmd=viewdetail&f_id=30
+ PES6

+ Archivo de imagen .png que contenga las banderas que quieras insertar.
Algunas:
Banderas by Mitalca
Banderas by Rolo
EXTRA:
Un map de banderas que no es 100% fiable pero sirver para darse una idea. Igual, no recomiendo para nada basarse en el, sino hacer como en el tutorial.
http://rapidshare.com/files/15305417/Map_Banners.txt.html
MUY RECOMENDADO:
+ Parche de banderas en HD de Asiat:
Aumenta el tamaño original de las mismas (de 128X128 a 256X256), con lo cual se ven con MUCHISIMA más definición. Ademas, cambia las banderas originales del juego por las de los equipos reales (x ej, las banderas del West Ham en vez de las del West Bromwich Mongo).
http://www.pesoccerworld.com/modules.php?name=Forums&file=viewtopic&t=37367