Bueno una solución fue bastante arcaica, pero por lo menos me resulto a mí, porque también tenia el mismo problema.
Acá está.
Al cambiar los emblemas, lo hice con el "dt04.img" con los unnamed que correpsondian a los emblemas, pero eso no resulto, ya que con la actualización de KONAMI, un unnamed, se derivo al "dt0f.img", pero que esta alojado, por lo menos en Win 7, en aps data/konami/descargas/dt0f.img (si mal no recuerdo), y en esa actualización agregue los nuevos emblemas, creo que los unnamed son los 64 y 65 (si mal no recuerdo).
Entonces los cambie desde ahí, obviamente hice una copia de seguridad del archivo .img. y listo, lo guarde y todo el cuento. Entre al PES12, y no resulto, los emblemas salian con una "X", pero me di cuenta que los equipos licenciados, si se veian los nuevos emblemas, entonces me dije. ¿POR QUÉ NO HAGO QUE TODOS SEAN LICENCIADOS?. pero resulto otro problema ¿Con qué programa hago que los equipos sean licenciados?, y me acorde que en pes PES11, habia un programa que se llama "MAP EDITOR", y este programa tenia la opcion de licenciar los equipos, además de cambiar su ubicación geografica.
Por ende comence a buscar el "MAP EDITOR" para PES12, y lo encontre aqui mismo.
Entonces cargué los unnamed que requiere, 30,31,32 (si mal no recuerdo), pero estos los saque del "dt04.img" y los guarde en el kitserver, y volvi a correr el PES12 y RESULTÓ, todos los equipos con sus emblemas modificados.
ME DIJE ORALE, RESULTÓ.
Nota 1: No tengo ningún parche sobre mi PES12.