A ver, la vergüenza no es Konami, sino que te quejes porque una actualización OFICIAL de Konami te ha jodido un parche NO OFICIAL.
Has avisado a Konami de que tenías un parche? A que no?
Respecto a tu problema, debes hacer una instalación limpia, sin kitserver, ni parches, ni nada, y actualizar el
parche oficial a la versión 1.3 (web) y
las actualizaciones DLC a la 1.4 (dentro del juego, en ajustes de sistema). Lo que te pasa es porque tienes algún archivo, digamos, "residual", de algún parche, y te crea conflicto con los archivos originales del juego.