buenas voy a ver si te ayudo un pokillo
lo primero vamos con el tema del kitserver para realizar la instalacion debes estraerlo en tu carpeta de instalacion del proevolution soccer 6 la mia por defecto es
C:\Archivos de programa\KONAMI\Pro Evolution Soccer 6
dentro de esta carpeta te creara otra llamada kitserver, pues bien en el interior tendras un setup.exe ejecutalo seleccionas el el pes6.exe y le das a install , con esto ya tendras tu kitserver instalado.
para instalar caras y todo lo que se puede meter con el kitserver te recomiendo que mires los ejemplos que trae el kitserver y veas su funcionamiento importantes son los map.txt y los uni.txt dentro de las carpetas de todos modos si tienes dudas pregunta en el foro de herramientas y edicion

, otra recomendacion es que si dominas el ingles te leas o heches un vistazo a manual.html que se encuentra en la siguiente carpeta
C:\Archivos de programa\KONAMI\Pro Evolution Soccer 6\kitserver\docs
con el pesfan editor , cierto es que no necesita instalacion pero necesitas tener una version de java, te recomiendo que te descargues la ultima version y la instales aki tienes el enlace
http://www.java.com/en/download/manual.jsp
una vez instalado la ultima version de java ejecuta el PES Editor 6.0.x.jar
y abre el archivo KONAMI-WIN32PES6OPT que se encuentra en la carpeta
C:\Documents and Settings\USER\Mis documentos\KONAMI\Pro Evolution Soccer 6\save\folder1
con esto creo que ya resuelven tus dudas salvo lo de insertar caras y demas, de todos modos lo dicho primero estudia los ejemplos que trae y si tienes dudas..... ya sabes
saludos !!